Efecto de la modificación m6A sobre los mRNAs de moléculas claves de la señalización IFN/ISGs en microglía con HIV-1 (VSV-G) en replicación activa y latencia

La activación de microglía infectada con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) en el sistema nervioso central libera citoquinas proinflamatorias, como interferones (IFNs) y genes estimulados por IFN (ISGs), que contribuyen al daño inflamatorio relacionado con el Trastorno Neurocognitivo Asociado al HIV (HAND). Tomando en cuenta que N6-metiladenosina (m6A) regula el destino de las moléculas de RNA (splicing, traducción, estabilidad y degradación) y que además se ha descrito que está relacionada con el control de la respuesta inmune y la replicación viral, en esta investigación se exploró la abundancia de la modificación m6A en los mRNAs de IFN/ISG de microglía infectada con HIV-1 en replicación activa y latencia. En esta tesis se vio que el perfil epitranscriptómico determinado por m6A-sequencing (m6A-seq) de 303 ISGs cambia en la microglía con replicación activa respecto a la microglía sin infección. La validación realizada en mRNA de ADAR y STAT2 por m6A-imunoprecipitación seguida por RT-qPCR mostró un incremento en la abundancia de modificaciones m6A durante la replicación activa, pero no durante la latencia. Aunque se observó un enriquecimiento de m6A en ambos transcritos, solamente STAT2 redujo sus niveles de mRNA y no se observó ningún cambio en los niveles de proteínas en ambos ISGs. Los resultados obtenidos para STAT2 y ADAR sugiere que m6A es un factor clave que regula la expresión de ISG en la microglía infectada con HIV-1 que podría ser parte de una posible respuesta compensatoria para mantener los niveles necesarios de la proteína para sostener el ciclo infectivo viral.