Desde el punto de vista de la investigación científica, la Facultad de Enfermería y Obstetricia tiene como propósito generar nuevo conocimiento para mejorar el cuidado de la persona, familia y comunidad y utilizar la investigación para la resolución de problemas en los distintos niveles de atención de salud.

Las líneas que desarrolla la Escuela de Enfermería son Investigación Aplicada a la Educación en Salud, Investigación Aplicada a la Gestión, Prácticas y Cuidados en salud y se concentran en la humanización en salud, la educación en Enfermería, la resolución de problemas sanitarios (de impacto nacional en la salud pública) y el cuidado de las personas, familias y comunidades. Por su parte, la Escuela de Obstetricia desarrolla la línea de Investigación Aplicada a la Salud de la Mujer, Materna y Perinatal, concentra sus indagaciones en aspectos como el embarazo adolescente como problema de salud pública, la lactancia materna, la educación en obstetricia y cuidados del recién nacido.