Efecto de la modificación m6A sobre los mRNAs de moléculas claves de la señalización IFN/ISGs en microglía con HIV-1 (VSV-G) en replicación activa y latencia

Masyelly Damarys Rojas Parra

Efecto de la modificación m6A sobre los mRNAs de moléculas claves de la señalización IFN/ISGs en microglía con HIV-1 (VSV-G) en replicación activa y latencia

Masyelly Damarys Rojas Parra

Doctorado en Biomedicina

Research output: Types of Thesis › Doctoral Thesis

Abstract

La activación de microglía infectada con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) en el sistema nervioso central libera citoquinas proinflamatorias, como interferones (IFNs) y genes estimulados por IFN (ISGs), que contribuyen al daño inflamatorio relacionado con el Trastorno Neurocognitivo Asociado al HIV (HAND). Tomando en cuenta que N6-metiladenosina (m6A) regula el destino de las moléculas de RNA (splicing, traducción, estabilidad y degradación) y que además se ha descrito que está relacionada con el control de la respuesta inmune y la replicación viral, en esta investigación se exploró la abundancia de la modificación m6A en los mRNAs de IFN/ISG de microglía infectada con HIV-1 en replicación activa y latencia. En esta tesis se vio que el perfil epitranscriptómico determinado por m6A-sequencing (m6A-seq) de 303 ISGs cambia en la microglía con replicación activa respecto a la microglía sin infección. La validación realizada en mRNA de ADAR y STAT2 por m6A-imunoprecipitación seguida por RT-qPCR mostró un incremento en la abundancia de modificaciones m6A durante la replicación activa, pero no durante la latencia. Aunque se observó un enriquecimiento de m6A en ambos transcritos, solamente STAT2 redujo sus niveles de mRNA y no se observó ningún cambio en los niveles de proteínas en ambos ISGs. Los resultados obtenidos para STAT2 y ADAR sugiere que m6A es un factor clave que regula la expresión de ISG en la microglía infectada con HIV-1 que podría ser parte de una posible respuesta compensatoria para mantener los niveles necesarios de la proteína para sostener el ciclo infectivo viral.

Original language	Spanish (Chile)
Supervisors/Advisors	Toro-Ascuy, Daniela, Director, External person Luz Crawford, Patricia Alejandra, Supervisor
Date of Award	18 Aug 2023
State	Published - 18 Aug 2023

UN SDGs

This output contributes to the following UN Sustainable Development Goals (SDGs)

SDG 3 Good Health and Well-being

Cite this

@phdthesis{9f2e949000884502954e30dc79dbb972,

title = "Efecto de la modificaci{\'o}n m6A sobre los mRNAs de mol{\'e}culas claves de la se{\~n}alizaci{\'o}n IFN/ISGs en microgl{\'i}a con HIV-1 (VSV-G) en replicaci{\'o}n activa y latencia",

abstract = "La activaci{\'o}n de microgl{\'i}a infectada con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) en el sistema nervioso central libera citoquinas proinflamatorias, como interferones (IFNs) y genes estimulados por IFN (ISGs), que contribuyen al da{\~n}o inflamatorio relacionado con el Trastorno Neurocognitivo Asociado al HIV (HAND). Tomando en cuenta que N6-metiladenosina (m6A) regula el destino de las mol{\'e}culas de RNA (splicing, traducci{\'o}n, estabilidad y degradaci{\'o}n) y que adem{\'a}s se ha descrito que est{\'a} relacionada con el control de la respuesta inmune y la replicaci{\'o}n viral, en esta investigaci{\'o}n se explor{\'o} la abundancia de la modificaci{\'o}n m6A en los mRNAs de IFN/ISG de microgl{\'i}a infectada con HIV-1 en replicaci{\'o}n activa y latencia. En esta tesis se vio que el perfil epitranscript{\'o}mico determinado por m6A-sequencing (m6A-seq) de 303 ISGs cambia en la microgl{\'i}a con replicaci{\'o}n activa respecto a la microgl{\'i}a sin infecci{\'o}n. La validaci{\'o}n realizada en mRNA de ADAR y STAT2 por m6A-imunoprecipitaci{\'o}n seguida por RT-qPCR mostr{\'o} un incremento en la abundancia de modificaciones m6A durante la replicaci{\'o}n activa, pero no durante la latencia. Aunque se observ{\'o} un enriquecimiento de m6A en ambos transcritos, solamente STAT2 redujo sus niveles de mRNA y no se observ{\'o} ning{\'u}n cambio en los niveles de prote{\'i}nas en ambos ISGs. Los resultados obtenidos para STAT2 y ADAR sugiere que m6A es un factor clave que regula la expresi{\'o}n de ISG en la microgl{\'i}a infectada con HIV-1 que podr{\'i}a ser parte de una posible respuesta compensatoria para mantener los niveles necesarios de la prote{\'i}na para sostener el ciclo infectivo viral.",

author = "\{Rojas Parra\}, \{Masyelly Damarys\}",

year = "2023",

month = aug,

day = "18",

language = "Espa{\~n}ol (Chile)",

}

TY - BOOK

T1 - Efecto de la modificación m6A sobre los mRNAs de moléculas claves de la señalización IFN/ISGs en microglía con HIV-1 (VSV-G) en replicación activa y latencia

AU - Rojas Parra, Masyelly Damarys

PY - 2023/8/18

Y1 - 2023/8/18

N2 - La activación de microglía infectada con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) en el sistema nervioso central libera citoquinas proinflamatorias, como interferones (IFNs) y genes estimulados por IFN (ISGs), que contribuyen al daño inflamatorio relacionado con el Trastorno Neurocognitivo Asociado al HIV (HAND). Tomando en cuenta que N6-metiladenosina (m6A) regula el destino de las moléculas de RNA (splicing, traducción, estabilidad y degradación) y que además se ha descrito que está relacionada con el control de la respuesta inmune y la replicación viral, en esta investigación se exploró la abundancia de la modificación m6A en los mRNAs de IFN/ISG de microglía infectada con HIV-1 en replicación activa y latencia. En esta tesis se vio que el perfil epitranscriptómico determinado por m6A-sequencing (m6A-seq) de 303 ISGs cambia en la microglía con replicación activa respecto a la microglía sin infección. La validación realizada en mRNA de ADAR y STAT2 por m6A-imunoprecipitación seguida por RT-qPCR mostró un incremento en la abundancia de modificaciones m6A durante la replicación activa, pero no durante la latencia. Aunque se observó un enriquecimiento de m6A en ambos transcritos, solamente STAT2 redujo sus niveles de mRNA y no se observó ningún cambio en los niveles de proteínas en ambos ISGs. Los resultados obtenidos para STAT2 y ADAR sugiere que m6A es un factor clave que regula la expresión de ISG en la microglía infectada con HIV-1 que podría ser parte de una posible respuesta compensatoria para mantener los niveles necesarios de la proteína para sostener el ciclo infectivo viral.

AB - La activación de microglía infectada con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) en el sistema nervioso central libera citoquinas proinflamatorias, como interferones (IFNs) y genes estimulados por IFN (ISGs), que contribuyen al daño inflamatorio relacionado con el Trastorno Neurocognitivo Asociado al HIV (HAND). Tomando en cuenta que N6-metiladenosina (m6A) regula el destino de las moléculas de RNA (splicing, traducción, estabilidad y degradación) y que además se ha descrito que está relacionada con el control de la respuesta inmune y la replicación viral, en esta investigación se exploró la abundancia de la modificación m6A en los mRNAs de IFN/ISG de microglía infectada con HIV-1 en replicación activa y latencia. En esta tesis se vio que el perfil epitranscriptómico determinado por m6A-sequencing (m6A-seq) de 303 ISGs cambia en la microglía con replicación activa respecto a la microglía sin infección. La validación realizada en mRNA de ADAR y STAT2 por m6A-imunoprecipitación seguida por RT-qPCR mostró un incremento en la abundancia de modificaciones m6A durante la replicación activa, pero no durante la latencia. Aunque se observó un enriquecimiento de m6A en ambos transcritos, solamente STAT2 redujo sus niveles de mRNA y no se observó ningún cambio en los niveles de proteínas en ambos ISGs. Los resultados obtenidos para STAT2 y ADAR sugiere que m6A es un factor clave que regula la expresión de ISG en la microglía infectada con HIV-1 que podría ser parte de una posible respuesta compensatoria para mantener los niveles necesarios de la proteína para sostener el ciclo infectivo viral.

M3 - Tesis doctoral

ER -